Shin e Kotori sono entrambi dei liceali al terzo anno. Shin ha perso la madre quando era piccolo e da allora ha la tendenza a chiudersi in sè stesso. Kotori è la sua amica d’infanzia che si è sempre presa cura di lui. Un giorno, un altro “sè stesso” da un altro Giappone appare di fronte a loro…

5 centimetri al secondo, è questa la velocità con la quale cadono i fiori di ciliegio durante la primavera: la delicatezza, il colore pallido, la brevità della sua esistenza sono il simbolo della fragilità, ma anche della bellezza dell’esistenza. Tutti sentimenti che condizionano la vita stessa di ognuno di noi. I tre episodi sono incentrati su tre momenti diversi della vita dei due personaggi principali, Takaki Tōno e Akari Shinohara. Viene quindi affrontata la loro storia di amicizia e l’evolversi di questa in un sentimento più forte che non viene sconfitto neanche dalla lontananza che separa i due personaggi.